تم تجهيز المركز الطبي بكلية الصيدلة جامعة عين شمس بالأجهزة واسرة الكشف الطبي والأدوية خاصةً أدوية الطوارئ والإسعاف الأولي للحروق والجروح وحوادث المعامل ويقوم المركز بالكشف الطبي على جميع الطلاب المستجدين قبل بداية العام الدراسي وتوعيتهم بالخدمات الطبية التي يقدمها المركز و تحديد الحالات التي تحتاج إلى علاج ومتابعه مستمرة مثل حالات مرض السكر وذلك للمتابعة وصرف العلاج بالكامل شهرياً .

المركز الطبي بالكلية يعمل طوال اليوم حتى نهاية الفترة المسائية ويستقبل المرضى من الطلاب والموظفين مع تقديم علاج الطوارئ و يتم تحويل الحالات الطارئه إلى المستشفى  و يقوم الأطباء في المركز بدور كبير في التوعية الصحية وخاصة للوقاية من بعض الأمراض في فترات انتشارها كما يقوم المركز بالتعاون مع إدارة الكلية بتنظيم حملات تطعيم ضد بعض الأمراض المعدية كما حدث اثناء جائحة الكورونا.